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私が行ったときは、サイゴンからプノンペンまでシンカフェバス（プノンペン泊）、
プノンペンからシェムリアップまでスピードボート（シェムリアップ泊）、
シェムリアップからバンコクまでバス、という経路でした。

カンボジアでのボートとバスは適当にその辺で見つけた旅行会社で予約しました。
ボートについては旅行会社で申し込んだほうが安いし、朝ホテルまで迎えにきてくれます。

国境の開門時間の関係や悪路・治安上の理由もあるので、
これより早いのって難しいんじゃないでしょうか。
カンボジア国内のことはカンボジア関係のHPで調べられたほうがいいと思いますが。