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それは実務的に還付は難しいと思いますね。
ベトナム国内向け製品と、日本向け製品の材料は同一、共通なのではないですか？
日本向け製品の材料のみ、別途調達なら可能だと思いますが。
国外向けは今回が初めてですか？

あと製品が何か分かりませんが、日本向けであればAJCEP用のC/O（原産地証明書）を取ったほうがいいと思います。
日本での輸入で原則関税ゼロになります。
詳しいことはJETROまで。