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まず大丈夫だと思います。
ベトナムエアーの往復チケットがある。
陸路での入出国にはエアーチケットチェックがない。
ベトナム入国はバンコクからエアーアジア、陸路でカンボジア出国には、入国時にイミグレで質問されますが、問題になることはないと思います。
説明がめんどうになるので、シンプルな英文で日本からの日程とルートを作成して、プリントし、イミグレにベトナムエアーのチケットと一緒に提出するのがよろしいかと思います。
イミグレの係官に疑念を抱く時間＝質問時間を与えないようにするとスムーズに通過するようです。