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時々この類の質問が出ますね。
入国、再入国時に15日以内出国用チケットを持ってるわけですから
制度上問題はないでしょう。
ただルートを考えれば、往復ＶＮ利用で往路日本→（ホーチミン、トランジット）
→シェムリアプ、シェムリアプ〜プノンペン〜ホーチミンは陸路、
帰路ホーチミン→日本の方がベトナムに再入国の必要がない分スムーズでしょうね。
以下にノービザで入国の際モメた情報が載ってます。
事情が違いますのであくまで参考まで。

http://www.ryokojin.co.jp/mfb/float.cgi?bbs=main&thread=50315090824&last=20